上宮である日峯山は標高約113メートル、古来は北部九州唯一の火山系に属しており往時は盛んに火山活動があり、噴煙は玄海を隔てて洋上を遠く壱岐対馬は愚か唐国までも照らし、日韓航行の船舶に対し自然の灯台となっていました。
また近年まで、玄界灘・洞海湾の入船出船の目標にもなっていました。
山の頂上付近に鎮座する3つの岩（琵琶岩・上臈岩・国見岩）のうち、東南に鎮座していた上臈岩は、日峯配水池築造のため、昭和55（西暦1980）年2月23日、今の境内地に祭祀いたしました。上宮と下宮は山続きで繋がっていましたが、市の宅地開発により分断され、現在は上宮への参道入口が別の場所となっています。